Nomenclatura EC de enzimas: clases, código y ejemplos
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Resumen
El documento explica cómo se nombran las enzimas según el sistema EC, creado por la Comisión Enzimática de la Unión Internacional de Bioquímica. Describe el código EC de cuatro números y las clases de enzimas: oxidorreductasas, transferasas, hidrolasas y liasas, con la reacción general y ejemplos de cada una. El código sirve para identificar una enzima por la reacción que cataliza.
Puntos clave
- La Unión Internacional de Bioquímica propuso el esquema en 1956, y se aceptó oficialmente en 1961.
- El código EC empieza por las letras EC y tiene cuatro números separados por puntos.
- El primer número indica la clase de la enzima, según el tipo de reacción que cataliza.
- Clase 1, oxidorreductasas: transfieren electrones o hidrógeno de un sustrato a otro.
- Clase 2, transferasas: transfieren grupos funcionales distintos del hidrógeno entre un donador y un aceptor.
- Clase 3, hidrolasas: rompen enlaces con la ayuda de una molécula de agua.
- Clase 4, liasas: rompen enlaces por medios distintos de la hidrólisis y la oxidación.
- Para citar una enzima completa se usan los cuatro números, por ejemplo EC 1.1.1.1.
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Nomenclatura y clasificación de enzimas
Inicialmente, las enzimas recibieron nombres asignados por sus descubridores, tales como pepsina, tripsina, etc. Posteriormente, se comenzó a designar su nombre añadiendo el sufijo asa al nombre del sustrato sobre el que actúan, para indicar así su especificidad. Por ejemplo: la ureasa actúa sobre la urea; sin embargo, este nombre no indica qué le ocurre a la urea por acción de la ureasa.
Ante la necesidad de establecer una nomenclatura inequívoca para las enzimas, en 1956 la Unión Internacional de Bioquímica propuso un esquema de clasificación y nomenclatura que en 1961 se aceptó oficialmente. Esto dio lugar a la creación de una Comisión Enzimática para establecer normas que permitan nombrar las enzimas. Así, a cada enzima se le asigna un código alfanumérico encabezado por las letras EC (de Enzyme Commission), seguido de cuatro números separados por puntos, y un nombre sistemático que identifica la reacción que cataliza.
Formato del código EC
El primer número corresponde a una de las seis grandes clases en que se han dividido las enzimas y se basa en el tipo de reacción que catalizan. Los números siguientes definen la subclase, la subsubclase y la especificidad del sustrato cuando procede.
Clase 1 - Oxidorreductasas
Descripción: Participan en reacciones de oxidorreducción; es decir, transfieren electrones o hidrógeno de un sustrato a otro (por ejemplo en alcoholes, aldehídos, ácidos, dobles enlaces C=C, aminas, etc.).
En esta clase ya están definidas 14 subclases. La reacción general se puede representar así:
AH2 + B ⇌ A + BH2
Ared + Box ⇌ Aox + Bred
Ejemplos: citocromo c oxidasa (oxidasas), succinato deshidrogenasa (deshidrogenasas), peroxidasas, reductasas, etc.
Clase 2 - Transferasas
Descripción: Facilitan la transferencia de ciertos grupos funcionales (distintos del hidrógeno) entre un sustrato donador y un sustrato aceptor.
Las porciones que con más frecuencia se transfieren son: grupos amino, acilo, glucosilo, grupos monocarbonados y fosfato. Comprenden 8 subclases. La reacción general se puede representar así:
A–B + C ⇌ A + C–B
Ejemplos: transaminasas, glucoquinasas, transmetilasas, fosfotransferasas, etc.
Clase 3 - Hidrolasas
Descripción: Esta clase de enzimas se puede considerar una clase especial de transferasas en las que el sustrato se rompe y sus fragmentos se transfieren a los componentes de una molécula de agua (el aceptor siempre es una molécula de agua).
Catalizan la ruptura hidrolítica de enlaces como: ésteres (C–O), éteres (C–O), enlaces peptídicos (C–N), enlaces glicosídicos (C–O), anhídridos de ácido (C–O), enlaces fosfato (O–P) y enlaces sulfuro (C–S). Según el enlace que rompen, se conocen 9 subclases; entre las más importantes están las esterasas, amilasas y peptidasas.
La reacción general se puede representar así:
A–B + H2O ⇌ AH + B–OH
Ejemplos: glucosidasas, amidasas, lipasas, fosfatasas, carbohidrasas, etc.
Clase 4 - Liasas
Descripción: También llamadas sintasas, catalizan reacciones de ruptura de enlaces entre C–C, C–O, C–N y otros, por medios distintos a la hidrólisis y a la oxidación. Permiten reacciones en las cuales se remueven moléculas como agua, dióxido de carbono o amoníaco para formar dobles enlaces (C=C o C=O), o bien, a la inversa, añaden dichas moléculas a dobles enlaces.
La reacción general se puede representar así:
A–B ⇌ A + B
Ejemplos: descarboxilasas, desaminasas, deshidratases, hidratasas, etc.
Notas finales
- El sistema EC proporciona una nomenclatura sistemática y estandarizada que facilita la identificación y clasificación de enzimas según la reacción que catalizan.
- Además de las cuatro clases descritas en este apartado, existen otras clases (5 y 6) que completan la clasificación general establecida por la Comisión Enzimática.
- Para citar de forma completa una enzima se emplean los cuatro números del código EC (por ejemplo EC 1.1.1.1), que indican clase, subclase, subsubclase y especificidad.
Preguntas frecuentes
¿Qué significa el sufijo -asa en el nombre de una enzima?
Antes se añadía -asa al nombre del sustrato sobre el que actúa la enzima. Por ejemplo, la ureasa actúa sobre la urea, pero ese nombre no indica qué le ocurre a la urea.
¿Qué es la Comisión Enzimática?
Es el grupo creado tras la propuesta de 1956 para establecer normas que permitan nombrar las enzimas.
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