Evaluación genética con el método BLUP y selección de reproductores

Resumen

Este documento explica por qué el método BLUP de evaluación genética es insesgado y cómo permite comparar animales criados en distintos ambientes. Compara dos reproductores según su valoración genética y explica qué es la precisión del valor genético. También describe las fuentes de información, como la propia, la de los padres y la de la progenie, y el papel de los marcadores genéticos.

Puntos clave

BLUP significa Mejor Predicción Lineal Insesgada (Best Linear Unbiased Prediction).
Con BLUP se pueden comparar animales que han producido en distintos ambientes y tratamientos.
La precisión de un valor genético es la correlación esperada entre el valor genético verdadero y el estimado.
Para aumentar la precisión se pueden recoger varias medidas fenotípicas del animal, más información de parientes o un modelo con menor error estadístico.
A mayor heredabilidad, más peso tiene la información propia; a menor heredabilidad, más peso tiene la de los parientes.
Si solo se conoce uno de los progenitores, el índice de pedigrí pesa menos en el valor genético.
Un marcador es una secuencia o base nucleotídica con variabilidad alélica que se identifica con métodos bioquímicos.

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Evaluación Genética con el Método BLUP: Predicciones Insesgadas y Selección de Reproductores

1. ¿Por qué el método BLUP de evaluación genética es insesgado?

Una de las propiedades del método BLUP (Best Linear Unbiased Prediction, o Mejor Predicción Lineal Insesgada) es que es insesgado. Esto quiere decir que las predicciones de los valores genéticos están corregidas por efectos fijos, y los efectos fijos por los valores genéticos. De modo que esperamos que los valores genéticos de los individuos sean independientes de los efectos ambientales a los que ha estado sometido cada individuo, permitiendo comparar animales que han producido en diferentes ambientes y tratamientos. Esto no ocurre con los índices de selección.

2. Selección de Reproductores Basada en su Valoración Genética

El reproductor X tiene la siguiente valoración genética (aditiva) para él mismo y sus antecesores:

Bisabuelo: +110
Abuelo: +100
Padre: +100
Reproductor X: +150

Y el reproductor Y tiene:

Bisabuelo: +200
Abuelo: +200
Padre: +150
Reproductor Y: +100

¿Cuál de los dos reproductores es más adecuado seleccionar? ¿Por qué?

Debemos elegir el reproductor X porque su valor genético es más alto (+150). El valor genético de un individuo ya tiene en cuenta los valores genéticos de todos sus parientes. En este caso, parece que la vía materna de X es genéticamente mejor que la madre de Y, o bien que X ha heredado una mayor cantidad de variantes genéticas favorables para el carácter.

3. Precisión del Valor Genético: Importancia y Métodos para Aumentarla

La precisión de un valor genético indica la correlación esperada entre el valor genético verdadero y el estimado. Podemos aumentar la precisión del valor genético recogiendo varias medidas fenotípicas del animal, y también recogiendo una mayor cantidad de información de los parientes. También mejorando el modelo de evaluación genética para tener un modelo con un menor error estadístico.

4. Fuentes de Información que Contribuyen al Valor Genético

Las fuentes de información que contribuyen al valor genético son:

La información propia (fenotipo y factores ambientales)
La información de los padres (índice de pedigrí)
La información de la progenie

A mayor heredabilidad, la información propia tiene mayor importancia, y si la heredabilidad es menor, la información de los parientes tiene un mayor peso en el cálculo del valor genético.

Si no se conocen los progenitores, al nacimiento no podemos calcular el índice de pedigrí. Si se conoce sólo uno de los progenitores, la información del índice de pedigrí contribuye con menor peso en el cálculo del valor genético.

5. Marcadores Genéticos y Genes: Su Implicación en la Mejora Genética

Un gen es una secuencia de ADN que codifica para una proteína que normalmente tiene un efecto sobre el fenotipo. Un marcador es una secuencia o base nucleotídica que presenta variabilidad alélica y que podemos identificar mediante métodos bioquímicos. Los marcadores nos permiten identificar los genes que contribuyen a la expresión del carácter a través de la utilización del desequilibrio de ligamiento y diferentes métodos estadísticos. Además, podemos calcular un valor genético o genómico utilizando una gran cantidad de marcadores a lo largo del genoma.

Preguntas frecuentes

¿Qué significa que el método BLUP sea insesgado?

Según el texto, las predicciones de los valores genéticos quedan corregidas por los efectos fijos, lo que permite comparar animales de distintos ambientes. Los índices de selección no tienen esta propiedad.

¿Qué es la precisión de un valor genético?

Es la correlación esperada entre el valor genético verdadero y el estimado. Se aumenta con más medidas propias, más información de parientes o un modelo de evaluación con menor error estadístico.

¿Qué es un marcador genético?

Es una secuencia o base nucleotídica con variabilidad alélica que se puede identificar con métodos bioquímicos. Permite identificar los genes que contribuyen al carácter gracias al desequilibrio de ligamiento.