Variabilidad Genética Intraespecífica en Quercus petraea y Quercus pyrenaica de Montejo de la Sierra
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Variabilidad genética intraespecífica en Quercus petraea y Quercus pyrenaica
Las medidas de la variabilidad genética intraespecífica analizadas con 5 microsatélites nucleares (nSSR) en las poblaciones de Q. petraea y Q. pyrenaica en Montejo de la Sierra (Madrid) proporcionan los valores fundamentales para entender su estructura genética. A continuación, se explican los conceptos a los que se refieren las iniciales de los parámetros evaluados, utilizando ejemplos de los resultados obtenidos.
Parámetros de diversidad alélica
- A (Número de alelos): Representa la cantidad total de alelos que posee un locus determinado. Por ejemplo, en el caso de QpZAG36, se encuentran 22 alelos en Q. petraea y 14 en Q. pyrenaica, mientras que en el locus QpZAG9 el número es idéntico para ambas especies.
- AeX (Número de alelos exclusivos): Se refiere a aquellos alelos que solo están presentes en una de las especies analizadas. En el locus QpZAG9, aunque ambas especies cuentan con 17 alelos, solo comparten 14; esto significa que cada especie presenta tres alelos diferentes que no aparecen en la otra.
Heterozigosidad y equilibrio genético
- He (Heterozigosidad esperada): Es la frecuencia de heterocigotos que se esperaría encontrar si la población cumpliera con la Ley de Hardy-Weinberg. La heterozigosidad esperada para un locus determinado se calcula mediante la fórmula: He = 1 - Σ pi2, donde pi es la frecuencia del alelo i.
- Por ejemplo, para un locus con 10 alelos como el MSQ13 en Q. petraea, el resultado (0,81) depende principalmente de las frecuencias de los alelos más abundantes, ya que los alelos raros apenas contribuyen a esta medida. Los genotipos heterocigotos resultan de elevar al cuadrado las frecuencias alélicas presentes en la expresión (p1 + p2 + p3 + ... + p10)2.
- Ho (Heterozigosidad observada): Es la frecuencia real de individuos heterocigotos que se observan directamente al aplicar los marcadores a la población. En el caso de MSQ13 en Q. petraea, el valor es de 0,81, lo cual coincide con la esperada si la población estuviese en equilibrio de Hardy-Weinberg (HW).
- D (Déficit de heterocigotos): Se calcula mediante la fórmula D = (He - Ho) / He. Este parámetro mide en qué proporción un determinado locus no cumple con las condiciones de la Ley de HW. En el locus MSQ13, se observa un déficit de heterocigotos muy destacado cuando los valores presentan una diferencia notable, como Ho (0,40) y He (0,59).
- D-HW (Desviación del equilibrio HW): Indica para cada locus y especie si se encuentran en condiciones de equilibrio y el nivel de significación estadística de dicha desviación. En el estudio, solo en tres de los diez casos analizados no se cumple el equilibrio; específicamente ocurre en MSQ13 para Q. pyrenaica, mientras que este mismo locus sí está en equilibrio en Q. petraea.
Identificación y parentesco
P Id (Probabilidad de Identidad): Estima la facilidad de identificar con un 100% de probabilidad los parentales de un individuo entre los adultos cuyo genotipo ha sido identificado en la población. El mejor marcador individual es el locus QpZAG110 en Q. pyrenaica, ya que posee 23 alelos y 7 de ellos son exclusivos, lo que otorga una gran capacidad de discriminación. No obstante, la probabilidad de identificación alcanza el 100% cuando se aplican conjuntamente los 5 locus analizados.